Experto/a en Análisis de Datos Genómicos y Metagenómicos

Módulos/Materia/Módulo y responsable académico

ECTS

Materias / Módulos

Experto/a en Análisis de Datos Genómicos y Metagenómicos

Módulo 1: Módulo 1: Uso y aplicaciones de la secuenciación masiva

3,5

Tema 1: Introducción a la secuenciación

Responsable: Emma Barahona

Tema 2: Tecnologías de secuenciación masiva

Descripción: El/la estudiante adquiere una base sólida y actualizada sobre los fundamentos y aplicaciones de la secuenciación masiva (NGS), permitiéndole adquirir competencias esenciales para comprender y analizar datos genómicos y metagenómicos.

Tema 3: Aplicaciones de la metagenómica

*8 horas optativas: formato presencial (prácticas de laboratorio) o formato virtual (prácticas de ordenador).

Tema 4: Microbioma

Tema 5: Preparación de librerías: metagenómica y metagenómica dirigida

Módulo 2: Programación y sistemas informáticos aplicados a la bioinformática

3

Tema 1: Sistemas operativos.

Responsable: Manuel Arrayás

Tema  2: Programación en Python

Descripción: El/la estudiante aquiere las competencias técnico‑computacionales fundamentales para desenvolverse en el entorno profesional de la bioinformática. A través del aprendizaje de sistemas operativos y lenguajes de programación esenciales, este módulo permite adquirir las bases necesarias para el análisis de datos genómicos y metagenómicos, así como para la automatización de tareas y el manejo eficiente de grandes volúmenes de información.

Tema 3:Programación en R

Módulo 3:  Introducción al procesado y análisis de datos genómicos y metagenómicos

2

Tema 1: Conceptos y herramientas para el control de calidad y preprocesamiento .

Responsable: Natalia González Benítez

Tema 2: Conceptos y herramientas para identificación y mapping

Descripción: El/la estudiante adquiere las bases prácticas y conceptuales necesarias para comprender cómo se procesan y analizan los datos producidos por tecnologías de secuenciación masiva, tanto en estudios genómicos como metagenómicos.

Tema 3: Conceptos y herramientas para ensamblado y anotación

Módulo 4: Aplicaciones de genómica y metagenómica dirigida

5,5

Tema 1: Aplicaciones de datos genómicos y metagenómicos (Virus)

Responsable: Sergio Álvarez Pérez

Tema 2: Aplicaciones de datos genómicos y metagenómicos (Procariotas)

Descripción: El/la estudiante adquiere una visión aplicada y comparativa del uso de datos genómicos y metagenómicos en distintos tipos de organismos, permitiéndole comprender cómo se adaptan las metodologías bioinformáticas según el grupo biológico analizado.

Tema 3: Aplicaciones de datos genómicos y metagenómicos. Eucariotas I (Hongos)

Tema 4: Genómica y metagenómica de eucariotas II: plantas

Tema 5: Genómica y metagenómica de eucariotas III: animales

Emma Barahona Martín

Profesora Ayudante Doctorado

Sí

2

2

Área: Microbiología

Departamento: Biología

Módulo 1: Uso y aplicaciones de la secuenciación masiva

Docencia Universitaria: 10 años. Asignaturas: Microbiología Alimentaria, Biología, Biorreactores, Diagnóstico molecular, Patología Animal, Biotecnología.

10

Natalia Gonzalez Benítez

Titular de universidad

Sí

4+1

4

5

Área: Microbiología

Departamento: Biología

Módulo 1: Uso y aplicaciones de la secuenciación masiva

Microbiología aplicada e  interpretación de datos genómicos y metagenómicos

5

Raquel Pino Bodas

PPL 

Sí

Área: Botánica.

Departamento: Biología

Módulo 1: Uso y aplicaciones de la secuenciación masiva.

Módulo 4: Aplicaciones de genómica y metagenómica dirigida

Biología.

Experiencia en filogenía, análisis de SNPs y ensamblado de genomas

17

Carlos Lara Romero

PPL

Sí

2

1

1

Área: Botánica

Departamento: Biología

Módulo 2: Programación y sistemas informáticos aplicados a la bioinformática

Investigación sobre señales genómicas de adaptación

6

Jesús López Angulo

Investigador Doctor

Sí

Área: Ecología

Departamento: Biología

Módulo 2: Programación y sistemas informáticos aplicados a la bioinformática

Modelos y análisis estadísticos aplicados a los datos genómicos y metagenómicos.

4

Manuel Arrayás Chazeta

Catedrático Universidad

Sí

4

4

4

Área de Electromagnetismo,

Matemática Aplicada, Ciencia e Ingeniería de los Materiales y Tecnología Electrónica

Módulo 2: Programación y sistemas informáticos aplicados a la bioinformática

Programación en entornos Linux y en el desarrollo de scripts en Python para automatización, análisis de datos y gestión de pipelines bioinformáticos

15

Michael Christian Karim Stich

Titular de Universidad

Si

4

1

1

Matemática Aplicada. Matemática Aplicada, Ciencia e Ingeniería de los Materiales y Tecnología Electrónica

Módulo 4: Aplicaciones de genómica y metagenómica dirigida

Programación en entornos Linux, análisis de datos y gestión de pipelines bioinformáticos

8

Irene Villa Machío

PPI

SI

Área: Botánica.

Departamento: Biología

Módulo 2: Programación y sistemas informáticos aplicados a la bioinformática

Bioinformática.

Experiencia en el procesamiento de datos genómicos, filogenómica y genómica poblacional

10

Sergio Alvarez Pérez

Ayudante doctor

Sí

0

0

0

Área: Microbiología

Departamento: Biología

Módulo 4: Aplicaciones de genómica y metagenómica dirigida

Caracterización de microorganismos procariotas utilizando técnicas moleculares y análisis bioinformáticos en el ámbito del  procesamiento de datos genómicos y metagenómicos

8

Ernesto Recuero Gil

Ayudante doctor

Sí

Área: Zoología

Departamento: Biología

Módulo 4: Aplicaciones de genómica y metagenómica dirigida

Caracterización de organismos eucariotas utilizando técnicas moleculares y análisis bioinformáticos en el ámbito del  procesamiento de datos genómicos y metagenómicos

4

Mario Reguero Escudero

Ayudante doctor

Sí

1

Área: Zoología

Departamento: Biología

Módulo 4: Aplicaciones de genómica y metagenómica dirigida

Caracterización de organismos eucariotas utilizando técnicas moleculares y análisis bioinformáticos en el ámbito del  procesamiento de datos genómicos y metagenómicos

4

Alfredo García Fernández

Titular de Universidad

Sí

2

2

3

Área: Botánica

Departamento: Biología

Módulo 4: Aplicaciones de genómica y metagenómica dirigida

Caracterización de organismos eucariotas enfocado en plantas utilizando técnicas moleculares y análisis bioinformáticos en el ámbito del  procesamiento de datos genómicos y metagenómicos

8

Nº Total profesorado URJC

12

% Profesorado doctor

100%

% Total de horas impartidas

86%

Ricardo Ramos

Director de IMDEA Alimentación y responsable científico de la plataforma GENYAL 

Sí

Módulo 3: Introducción al procesado y análisis de datos genómicos y metagenómicos

Biología Computacional 

8

María García-Beccaria

Investigadora IMDEA

Sí

Módulo 3: Introducción al procesado y análisis de datos genómicos y metagenómicos

Biología Computacional

6

Nicolás de Cárdenas Roig

Investigador IMDEA

No

Módulo 3: Introducción al procesado y análisis de datos genómicos y metagenómicos

Biología Computacional

6

Nº Total profesorado externo

3 

% Profesorado doctor

66%

% Total de horas impartidas

14%