Según sus Estatutos, la CDED será gestionada y representada por una Comisión Permanente que tendrá las siguientes facultades:
- Dirigir las actividades sociales y llevar la gestión administrativa de la CDED, acordando realizar los oportunos contratos y actos.
- Ejecutar los acuerdos de la Asamblea General.
- Resolver sobre la admisión de nuevos miembros ordinarios, una vez confirmado su cargo de dirección de una escuela de doctorado o, en su defecto, de responsable de la organización de los estudios de doctorado de una universidad del estado español.
- Proponer a la Asamblea General la admisión de miembros asociados, justificando su conveniencia e interés.
- Cualquier otra facultad que no sea de la exclusiva competencia de la Asamblea General de socios.
Composición actual
- Presidente: Juan Florencio Tejeda Sereno (Universidad de Extremadura)
- Vicepresidente: Maribel Peró Cebollero (Universitat de Barcelona)
- Secretario: Antonio Collazo Fernández (Universidad de Vigo)
- Vocal: M Ángeles Davia Rodríguez (Universidad de Castilla-La Mancha)
- Vocal: Juan Arturo Rubio Arostegui (Universidad Antonio de Nebrija)
- Vocal: Ana María Rodríguez Guerrero (Universitat de les Illes Balears)
- Vocal: Ingrid J. Garzón Bello (Universidad de Granada)