Según sus Estatutos, la CDED será gestionada y representada por una Comisión Permanente que tendrá las siguientes facultades:
- Dirigir las actividades sociales y llevar la gestión administrativa de la CDED, acordando realizar los oportunos contratos y actos.
- Ejecutar los acuerdos de la Asamblea General.
- Resolver sobre la admisión de nuevos miembros ordinarios, una vez confirmado su cargo de dirección de una escuela de doctorado o, en su defecto, de responsable de la organización de los estudios de doctorado de una universidad del estado español.
- Proponer a la Asamblea General la admisión de miembros asociados, justificando su conveniencia e interés.
- Cualquier otra facultad que no sea de la exclusiva competencia de la Asamblea General de socios.
Composición actual
- Presidente en funciones: Juan Florencio Tejada Sereno (Universidad de Extremadura)
- Secretario: Antonio Collazo Fernández (Universida de de Vigo)
- Vocal: Maribel Peró Cebollero (Universidad de Barcelona)
- Vocal: Miguel Remacha Moreno (Universidad Autónoma de Madrid)
- Vocal: María Ángeles Davia Rodríquez (Universidad de Castilla-La Mancha)
- Vocal: Juan Arturo Rubio Arostegui (Universidad Nebrija)
- Vocal: Ana María Rodríguez Guerrero (Universitat de les Illes Balears)