El CAT es un centro pluridisciplinar formado por dos tipos de instalaciones: Servicios Centrales de apoyo a la investigación, Laboratorios y Plantas Piloto.

Servicios centrales de Apoyo a la Investigación
- Unidad de Microscopía Electrónica
     TEM
     ESEM
- Unidad de Técnicas Instrumentales
     RMN SÓLIDOS 
     RMN LÍQUIDOS.

     DRX y FRX
- Taller Mecánico
- Unidad de Genómica (Campus de Alcorcón)
- Unidad de Animalario (Campus de Alcorcón)


Laboratorios y Plantas Piloto
- Laboratorio de Computación y Visualización Avanzada - Cluster de PC
- Laboratorio Integrado de Caracterización de Materiales - LICAM
- Plantas Piloto de Ingeniería Química y Tecnologías del Medio Ambiente
- Análisis y tratamientos de Aguas - Planta Depuradora.
- Laboratorio de Análisis de Aguas.
- Laboratorio de Caracterización de Polímeros y Síntesis de Catalizadores.
- Laboratorio de Cultivo Vegetal: Phytotrón, Invernadero.